Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EEF1A1P5Q5VTE0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms