Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-1Q3LI58 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms