Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 SEPT9-242ENST00000592098 503 ntTSL 410.72□□□□□ -0.691e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 KLC1-210ENST00000537046 875 ntTSL 310.12□□□□□ -0.798e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 KLC1-220ENST00000555856 535 ntTSL 38.36□□□□□ -1.078e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 XRN2-201ENST00000377191 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.138e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 KLC1-213ENST00000553325 976 ntTSL 27.6□□□□□ -1.198e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.298e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 DKC1-209ENST00000475966 902 ntTSL 58.43□□□□□ -1.069e-12■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 DKC1-204ENST00000426673 843 ntTSL 57.4□□□□□ -1.229e-12■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 DKC1-212ENST00000492372 406 ntTSL 26.94□□□□□ -1.39e-12■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.351e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 C2orf42-212ENST00000470096 579 ntTSL 412.56□□□□□ -0.41e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 TIA1-219ENST00000496452 853 ntTSL 212.56□□□□□ -0.41e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 TIA1-213ENST00000481650 549 ntTSL 410.69□□□□□ -0.71e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 TIA1-210ENST00000474809 915 ntTSL 59.97□□□□□ -0.811e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 TIA1-203ENST00000415783 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.861e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 TIA1-205ENST00000433529 4647 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.911e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 TIA1-204ENST00000416149 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.171e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.371e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 TIA1-211ENST00000477044 904 ntTSL 56.35□□□□□ -1.391e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 TIA1-202ENST00000361692 543 ntTSL 52.78□□□□□ -1.961e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.321e-9■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 TAF1D-212ENST00000529794 1123 ntTSL 25.77□□□□□ -1.493e-10■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 TAF1D-209ENST00000528734 664 ntTSL 25.09□□□□□ -1.593e-10■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 TAF1D-202ENST00000393259 547 ntTSL 34.1□□□□□ -1.753e-10■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.362e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC11.23□□□□□ -0.612e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.622e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.742e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 MATR3-237ENST00000509990 3249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.782e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt9.21□□□□□ -0.942e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt9.2□□□□□ -0.942e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 MATR3-201ENST00000394805 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.242e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.32e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.322e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 MATR3-210ENST00000504643 2560 ntTSL 25.97□□□□□ -1.452e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.582e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.592e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.612e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 MATR3-211ENST00000505625 7306 ntTSL 1 (best)4.77□□□□□ -1.652e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.692e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 MATR3-219ENST00000512040 642 ntTSL 33.77□□□□□ -1.812e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 MATR3-202ENST00000502422 2250 ntTSL 1 (best)3.61□□□□□ -1.832e-7■■□□□ 12.8
SRSF7Q16629 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.64e-7■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 GTPBP4-203ENST00000483839 596 ntTSL 26.85□□□□□ -1.314e-7■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 TGIF2-206ENST00000560025 923 ntTSL 315.12■□□□□ 0.019e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.029e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 PHKA2-203ENST00000469485 1945 ntTSL 214.64□□□□□ -0.079e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 ZNF638-226ENST00000494621 871 ntTSL 314.34□□□□□ -0.119e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 PHKA2-204ENST00000469645 728 ntTSL 513.62□□□□□ -0.239e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.349e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 ZNF638-206ENST00000437658 931 ntTSL 212.89□□□□□ -0.359e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.449e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 TGIF2-204ENST00000558028 638 ntTSL 211.82□□□□□ -0.529e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.532e-19■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.549e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 ZNF638-213ENST00000466330 746 ntTSL 311.46□□□□□ -0.579e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 PHKA2-206ENST00000473739 751 ntTSL 311.36□□□□□ -0.599e-6■■□□□ 12.7
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SRSF7Q16629 ZNF638-212ENST00000464375 626 ntTSL 311.12□□□□□ -0.639e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.72e-19■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 TGIF2-203ENST00000557885 659 ntTSL 210.66□□□□□ -0.79e-6■■□□□ 12.7
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SRSF7Q16629 ZNF638-204ENST00000410075 3518 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.983e-8■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 ZNF638-207ENST00000454122 731 ntTSL 38.73□□□□□ -1.019e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 ZNF638-208ENST00000454278 595 ntTSL 48.58□□□□□ -1.049e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 ZNF638-220ENST00000487707 592 ntTSL 38.1□□□□□ -1.119e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 TGIF2-208ENST00000611732 3344 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.129e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 TGIF2-205ENST00000558465 785 ntTSL 37.87□□□□□ -1.159e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 TNRC6A-215ENST00000568903 943 ntTSL 27.52□□□□□ -1.219e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 TNRC6A-203ENST00000450465 3700 ntTSL 27.37□□□□□ -1.239e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 HSP90AA1-204ENST00000554401 1710 ntTSL 1 (best)7.29□□□□□ -1.242e-19■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.369e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.399e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 TNRC6A-207ENST00000491718 7956 ntTSL 1 (best)5.77□□□□□ -1.499e-6■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 HSP90AA1-203ENST00000553585 581 ntTSL 35.39□□□□□ -1.557e-34■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.613e-8■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 HSP90AA1-210ENST00000560130 488 ntTSL 24.26□□□□□ -1.733e-19■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.83e-8■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC7.94□□□□□ -1.141e-15■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 KPNA4-203ENST00000483437 510 ntTSL 54.86□□□□□ -1.631e-15■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 SRSF11-214ENST00000484162 4008 ntTSL 1 (best)5.44□□□□□ -1.544e-8■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 SRSF11-208ENST00000463859 1035 ntTSL 55.42□□□□□ -1.544e-8■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 SRSF11-205ENST00000460795 528 ntTSL 24.89□□□□□ -1.634e-8■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.694e-8■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 SRSF11-216ENST00000489188 784 ntTSL 23.92□□□□□ -1.784e-8■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 SRSF11-206ENST00000461935 3501 ntTSL 1 (best)3.77□□□□□ -1.814e-8■■□□□ 12.7
SRSF7Q16629 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.268e-10■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.318e-10■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 DIDO1-206ENST00000395340 7551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.148e-10■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.597e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 TMEM165-205ENST00000508404 1657 ntTSL 218.45■□□□□ 0.547e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.417e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.097e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.122e-6■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.172e-6■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 ATXN2L-223ENST00000568266 1294 ntTSL 513.54□□□□□ -0.247e-7■■□□□ 12.6
SRSF7Q16629 ATXN2L-226ENST00000570284 701 ntTSL 512.91□□□□□ -0.347e-7■■□□□ 12.6
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