RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466330.5

ZNF638-213, Transcript of zinc finger protein 638, humanhuman

TSL 3

Gene ZNF638, Length 746 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF638-213ENST00000466330 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.36■■■■□ 3.57
ZNF638-213ENST00000466330 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.37■■■□□ 2.93
ZNF638-213ENST00000466330 ABCC9O60706 1549 aa33.29■■■□□ 2.92
ZNF638-213ENST00000466330 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.7■■■□□ 2.67
ZNF638-213ENST00000466330 NACADO15069 1562 aa31.54■■■□□ 2.64
ZNF638-213ENST00000466330 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.48■■■□□ 2.63
ZNF638-213ENST00000466330 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.19■■■□□ 2.58
ZNF638-213ENST00000466330 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.18■■■□□ 2.58
ZNF638-213ENST00000466330 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.07■■■□□ 2.56
ZNF638-213ENST00000466330 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31■■■□□ 2.55
ZNF638-213ENST00000466330 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
ZNF638-213ENST00000466330 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.85■■■□□ 2.53
ZNF638-213ENST00000466330 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.84■■■□□ 2.53
ZNF638-213ENST00000466330 SCRIBQ14160 1630 aa30.47■■■□□ 2.47
ZNF638-213ENST00000466330 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.36■■■□□ 2.45
ZNF638-213ENST00000466330 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.06■■■□□ 2.4
ZNF638-213ENST00000466330 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
ZNF638-213ENST00000466330 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.96■■■□□ 2.39
ZNF638-213ENST00000466330 NCAPD3P42695 1498 aa29.17■■■□□ 2.26
ZNF638-213ENST00000466330 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.1■■■□□ 2.25
ZNF638-213ENST00000466330 SMARCA4P51532 1647 aa29.08■■■□□ 2.25
ZNF638-213ENST00000466330 SMARCA2P51531 1590 aa28.96■■■□□ 2.23
ZNF638-213ENST00000466330 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
ZNF638-213ENST00000466330 HMGXB3Q12766 1538 aa28.91■■■□□ 2.22
ZNF638-213ENST00000466330 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.81■■■□□ 2.2
ZNF638-213ENST00000466330 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.8■■■□□ 2.2
ZNF638-213ENST00000466330 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
ZNF638-213ENST00000466330 NESP48681 1621 aa28.68■■■□□ 2.18
ZNF638-213ENST00000466330 ERCC6Q03468 1493 aa28.67■■■□□ 2.18
ZNF638-213ENST00000466330 CUX2O14529 1486 aa28.58■■■□□ 2.17
ZNF638-213ENST00000466330 WIZO95785 1651 aa28.45■■■□□ 2.15
ZNF638-213ENST00000466330 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.44■■■□□ 2.14
ZNF638-213ENST00000466330 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.42■■■□□ 2.14
ZNF638-213ENST00000466330 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
ZNF638-213ENST00000466330 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
ZNF638-213ENST00000466330 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.29■■■□□ 2.12
ZNF638-213ENST00000466330 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.26■■■□□ 2.12
ZNF638-213ENST00000466330 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.24■■■□□ 2.11
ZNF638-213ENST00000466330 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.08
ZNF638-213ENST00000466330 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.02■■■□□ 2.08
ZNF638-213ENST00000466330 CFTRP13569 1480 aa28■■■□□ 2.07
ZNF638-213ENST00000466330 WDR62O43379 1518 aa27.95■■■□□ 2.06
ZNF638-213ENST00000466330 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.95■■■□□ 2.06
ZNF638-213ENST00000466330 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.93■■■□□ 2.06
ZNF638-213ENST00000466330 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.81■■■□□ 2.04
ZNF638-213ENST00000466330 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
ZNF638-213ENST00000466330 PRDM2Q13029 1718 aa27.63■■■□□ 2.01
ZNF638-213ENST00000466330 TOPBP1Q92547 1522 aa27.44■■□□□ 1.98
ZNF638-213ENST00000466330 IFT140Q96RY7 1462 aa27.38■■□□□ 1.97
ZNF638-213ENST00000466330 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
ZNF638-213ENST00000466330 OSCARQ8IYS5 282 aa27.35■■□□□ 1.97
ZNF638-213ENST00000466330 ABCC8Q09428 1581 aa27.35■■□□□ 1.97
ZNF638-213ENST00000466330 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.33■■□□□ 1.97
ZNF638-213ENST00000466330 TRIM41Q8WV44 630 aa27.24■■□□□ 1.95
ZNF638-213ENST00000466330 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
ZNF638-213ENST00000466330 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
ZNF638-213ENST00000466330 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
ZNF638-213ENST00000466330 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
ZNF638-213ENST00000466330 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.15■■□□□ 1.941e-12■■■■■ 26.8
ZNF638-213ENST00000466330 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.11■■□□□ 1.93
ZNF638-213ENST00000466330 SOGA1O94964 1423 aa27.06■■□□□ 1.92
ZNF638-213ENST00000466330 CUX1P39880 1505 aa27.05■■□□□ 1.92
ZNF638-213ENST00000466330 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.03■■□□□ 1.92
ZNF638-213ENST00000466330 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
ZNF638-213ENST00000466330 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.94■■□□□ 1.9
ZNF638-213ENST00000466330 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.94■■□□□ 1.9
ZNF638-213ENST00000466330 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.94■■□□□ 1.9
ZNF638-213ENST00000466330 CHD1O14646 1710 aa26.92■■□□□ 1.9
ZNF638-213ENST00000466330 FBLN2P98095 1184 aa26.91■■□□□ 1.9
ZNF638-213ENST00000466330 ARHGEF11O15085 1522 aa26.89■■□□□ 1.89
ZNF638-213ENST00000466330 WDR97A6NE52 1622 aa26.85■■□□□ 1.89
ZNF638-213ENST00000466330 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.84■■□□□ 1.89
ZNF638-213ENST00000466330 GRIN2BQ13224 1484 aa26.78■■□□□ 1.88
ZNF638-213ENST00000466330 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
ZNF638-213ENST00000466330 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
ZNF638-213ENST00000466330 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.73■■□□□ 1.87
ZNF638-213ENST00000466330 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.72■■□□□ 1.87
ZNF638-213ENST00000466330 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.71■■□□□ 1.87
ZNF638-213ENST00000466330 SYNJ2O15056 1496 aa26.68■■□□□ 1.86
ZNF638-213ENST00000466330 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.65■■□□□ 1.86
ZNF638-213ENST00000466330 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.65■■□□□ 1.86
ZNF638-213ENST00000466330 ARAP1Q96P48 1450 aa26.65■■□□□ 1.86
ZNF638-213ENST00000466330 PBRM1Q86U86 1689 aa26.65■■□□□ 1.86
ZNF638-213ENST00000466330 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
ZNF638-213ENST00000466330 SYNJ1O43426 1573 aa26.63■■□□□ 1.85
ZNF638-213ENST00000466330 TOP2BQ02880 1626 aa26.62■■□□□ 1.85
ZNF638-213ENST00000466330 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.61■■□□□ 1.85
ZNF638-213ENST00000466330 GRIN2AQ12879 1464 aa26.44■■□□□ 1.82
ZNF638-213ENST00000466330 ADAMTS12P58397 1594 aa26.43■■□□□ 1.82
ZNF638-213ENST00000466330 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.39■■□□□ 1.81
ZNF638-213ENST00000466330 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.37■■□□□ 1.81
ZNF638-213ENST00000466330 NUP160Q12769 1436 aa26.37■■□□□ 1.81
ZNF638-213ENST00000466330 CEP170Q5SW79 1584 aa26.35■■□□□ 1.81
ZNF638-213ENST00000466330 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
ZNF638-213ENST00000466330 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.3■■□□□ 1.8
ZNF638-213ENST00000466330 SHROOM2Q13796 1616 aa26.21■■□□□ 1.79
ZNF638-213ENST00000466330 IGF1RP08069 1367 aa26.15■■□□□ 1.78
ZNF638-213ENST00000466330 JPH4Q96JJ6 628 aa26.11■■□□□ 1.77
ZNF638-213ENST00000466330 KIF27Q86VH2 1401 aa26.11■■□□□ 1.77
ZNF638-213ENST00000466330 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms