Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAMP3Q15836 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP3Q15836 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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