Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SKIV2LQ15477 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKIV2LQ15477 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms