Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.412e-8■■■■■ 30.3
PCBP1Q15365 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 30.3
PCBP1Q15365 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.691e-9■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 CTSD-204ENST00000433655 2006 ntTSL 517.71■□□□□ 0.421e-9■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.391e-9■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.251e-9■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.111e-9■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 AC068580.4-203ENST00000636397 4038 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.511e-9■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 METTL26-209ENST00000565163 485 ntTSL 321.36■■□□□ 1.016e-9■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 METTL26-213ENST00000568830 590 ntTSL 320.72■□□□□ 0.916e-9■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 METTL26-212ENST00000568773 499 ntTSL 219.54■□□□□ 0.726e-9■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 METTL26-208ENST00000564039 518 ntTSL 218.92■□□□□ 0.626e-9■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.254e-27■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 CD74-209ENST00000523208 767 ntTSL 512.67□□□□□ -0.384e-27■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 KANSL1-223ENST00000639150 1815 ntTSL 517.33■□□□□ 0.368e-7■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 KANSL1-203ENST00000571698 2276 ntTSL 515.69■□□□□ 0.18e-7■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 KANSL1-217ENST00000638269 3365 ntTSL 510.07□□□□□ -0.88e-7■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 KANSL1-226ENST00000639375 3392 ntTSL 59.27□□□□□ -0.938e-7■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 ABCF1-202ENST00000376545 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.653e-9■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 ABCF1-201ENST00000326195 3481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.723e-9■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 ABCF1-205ENST00000475993 2860 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.753e-9■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.355e-8■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.225e-8■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.145e-7■■■■■ 30.2
PCBP1Q15365 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.533e-7■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 SMARCD1-206ENST00000549274 611 ntTSL 310.82□□□□□ -0.683e-7■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 SMARCD1-205ENST00000548573 2095 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.813e-7■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.197e-7■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.077e-7■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.217e-7■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.271e-7■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.271e-7■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 FOXP4-201ENST00000307972 3745 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 OS9-208ENST00000546916 1028 ntTSL 222.72■■□□□ 1.231e-9■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11e-9■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.181e-9■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.241e-9■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.271e-9■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 OS9-202ENST00000315970 2691 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.331e-9■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 OS9-210ENST00000549307 3870 ntTSL 29.63□□□□□ -0.871e-9■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.324e-17■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.124e-17■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 RAD23B-203ENST00000419616 716 ntTSL 321.03■□□□□ 0.963e-7■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 RAD23B-204ENST00000442587 456 ntTSL 26.86□□□□□ -1.315e-12■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.335e-12■■■■■ 30.1
PCBP1Q15365 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.248e-8■■■■■ 30
PCBP1Q15365 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.058e-8■■■■■ 30
PCBP1Q15365 SAMD4B-213ENST00000610417 3664 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.698e-8■■■■■ 30
PCBP1Q15365 SAMD4B-214ENST00000611159 3662 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.778e-8■■■■■ 30
PCBP1Q15365 CDK18-206ENST00000462976 794 ntTSL 526.42■■□□□ 1.821e-6■■■■■ 30
PCBP1Q15365 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.211e-6■■■■■ 30
PCBP1Q15365 CDK18-204ENST00000443813 591 ntTSL 421.73■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 30
PCBP1Q15365 CDK18-209ENST00000478560 782 ntTSL 520.55■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 30
PCBP1Q15365 CDK18-218ENST00000507067 342 ntTSL 1 (best)19.96■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 30
PCBP1Q15365 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 30
PCBP1Q15365 CDK18-221ENST00000512922 1134 ntTSL 219.69■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 30
PCBP1Q15365 CDK18-213ENST00000504648 2435 ntTSL 218.57■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 30
PCBP1Q15365 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 30
PCBP1Q15365 FNDC3B-207ENST00000469491 2916 ntTSL 217.92■□□□□ 0.465e-7■■■■■ 30
PCBP1Q15365 FNDC3B-202ENST00000415807 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.495e-7■■■■■ 30
PCBP1Q15365 FNDC3B-201ENST00000336824 7904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 30
PCBP1Q15365 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.055e-7■■■■■ 30
PCBP1Q15365 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 30
PCBP1Q15365 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.456e-7■■■■■ 30
PCBP1Q15365 ST6GAL1-220ENST00000470633 4893 ntTSL 27.36□□□□□ -1.236e-7■■■■■ 30
PCBP1Q15365 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.336e-7■■■■■ 30
PCBP1Q15365 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.226e-7■■■■■ 29.9
PCBP1Q15365 PER1-214ENST00000582719 3677 ntTSL 512.56□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 29.9
PCBP1Q15365 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.496e-7■■■■■ 29.9
PCBP1Q15365 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.772e-68■■■■■ 29.9
PCBP1Q15365 INS-IGF2-201ENST00000356578 1706 ntTSL 519.22■□□□□ 0.672e-68■■■■■ 29.9
PCBP1Q15365 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.122e-68■■■■■ 29.9
PCBP1Q15365 INS-IGF2-205ENST00000641326 2861 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.472e-68■■■■■ 29.9
PCBP1Q15365 WBP2-208ENST00000588373 1374 ntTSL 217.16■□□□□ 0.349e-15■■■■■ 29.8
PCBP1Q15365 WNK2-207ENST00000448251 3224 ntTSL 213.35□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 29.8
PCBP1Q15365 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.525e-7■■■■■ 29.8
PCBP1Q15365 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.422e-9■■■■■ 29.8
PCBP1Q15365 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.012e-9■■■■■ 29.8
PCBP1Q15365 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.11e-16■■■■■ 29.8
PCBP1Q15365 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.891e-16■■■■■ 29.8
PCBP1Q15365 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.281e-16■■■■■ 29.8
PCBP1Q15365 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.921e-16■■■■■ 29.8
PCBP1Q15365 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.491e-16■■■■■ 29.8
PCBP1Q15365 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.461e-16■■■■■ 29.8
PCBP1Q15365 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 29.8
PCBP1Q15365 KANSL1-229ENST00000639531 2731 ntTSL 512.6□□□□□ -0.395e-9■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 KANSL1-231ENST00000639853 1425 ntTSL 58.63□□□□□ -1.035e-9■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 KANSL1-213ENST00000576248 452 ntTSL 34.33□□□□□ -1.725e-9■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.92e-12■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 GIT1-202ENST00000335356 660 ntTSL 331.31■■■□□ 2.69e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.49e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 GPR162-207ENST00000545321 683 ntTSL 228.57■■■□□ 2.169e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.019e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 MACROD1-208ENST00000545464 899 ntTSL 327.26■■□□□ 1.959e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.361e-10■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.329e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TP53INP2-204ENST00000451665 477 ntTSL 523.15■■□□□ 1.39e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TRIM41-208ENST00000515499 914 ntTSL 323.02■■□□□ 1.281e-7■■■■■ 29.7
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