RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462976.1

CDK18-206, Transcript of cyclin dependent kinase 18, humanhuman

TSL 5

Gene CDK18, Length 794 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18-206ENST00000462976 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.73■■■■■ 6.99
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CDK18-206ENST00000462976 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.78■■■■■ 5.56
CDK18-206ENST00000462976 NACADO15069 1562 aa49.57■■■■■ 5.53
CDK18-206ENST00000462976 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.26■■■■■ 5.48
CDK18-206ENST00000462976 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.1■■■■■ 5.45
CDK18-206ENST00000462976 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.79■■■■■ 5.4
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CDK18-206ENST00000462976 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.59■■■■■ 5.37
CDK18-206ENST00000462976 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.43■■■■■ 5.34
CDK18-206ENST00000462976 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.32■■■■■ 5.33
CDK18-206ENST00000462976 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.27■■■■■ 5.32
CDK18-206ENST00000462976 SCRIBQ14160 1630 aa47.81■■■■■ 5.24
CDK18-206ENST00000462976 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.8■■■■■ 5.24
CDK18-206ENST00000462976 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.06■■■■■ 5.12
CDK18-206ENST00000462976 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.02■■■■■ 5.12
CDK18-206ENST00000462976 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.82■■■■■ 5.09
CDK18-206ENST00000462976 NCAPD3P42695 1498 aa45.75■■■■■ 4.91
CDK18-206ENST00000462976 SMARCA4P51532 1647 aa45.71■■■■■ 4.91
CDK18-206ENST00000462976 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.64■■■■■ 4.9
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CDK18-206ENST00000462976 SMARCA2P51531 1590 aa45.58■■■■■ 4.89
CDK18-206ENST00000462976 HMGXB3Q12766 1538 aa45.47■■■■■ 4.87
CDK18-206ENST00000462976 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.33■■■■■ 4.85
CDK18-206ENST00000462976 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.22■■■■■ 4.83
CDK18-206ENST00000462976 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
CDK18-206ENST00000462976 ERCC6Q03468 1493 aa44.88■■■■■ 4.78
CDK18-206ENST00000462976 NESP48681 1621 aa44.78■■■■■ 4.76
CDK18-206ENST00000462976 CUX2O14529 1486 aa44.71■■■■■ 4.75
CDK18-206ENST00000462976 WIZO95785 1651 aa44.69■■■■■ 4.74
CDK18-206ENST00000462976 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.65■■■■■ 4.74
CDK18-206ENST00000462976 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.48■■■■■ 4.71
CDK18-206ENST00000462976 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.36■■■■■ 4.69
CDK18-206ENST00000462976 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.36■■■■■ 4.69
CDK18-206ENST00000462976 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
CDK18-206ENST00000462976 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.25■■■■■ 4.67
CDK18-206ENST00000462976 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.21■■■■■ 4.67
CDK18-206ENST00000462976 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.1■■■■■ 4.65
CDK18-206ENST00000462976 CFTRP13569 1480 aa43.96■■■■■ 4.63
CDK18-206ENST00000462976 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.93■■■■■ 4.62
CDK18-206ENST00000462976 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.84■■■■■ 4.61
CDK18-206ENST00000462976 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.83■■■■■ 4.61
CDK18-206ENST00000462976 WDR62O43379 1518 aa43.82■■■■■ 4.61
CDK18-206ENST00000462976 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.68■■■■■ 4.58
CDK18-206ENST00000462976 PRDM2Q13029 1718 aa43.56■■■■■ 4.56
CDK18-206ENST00000462976 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.43■■■■■ 4.54
CDK18-206ENST00000462976 ABCC8Q09428 1581 aa43.07■■■■■ 4.48
CDK18-206ENST00000462976 TOPBP1Q92547 1522 aa43.06■■■■■ 4.48
CDK18-206ENST00000462976 IFT140Q96RY7 1462 aa42.98■■■■■ 4.47
CDK18-206ENST00000462976 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.96■■■■■ 4.47
CDK18-206ENST00000462976 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.79■■■■■ 4.44
CDK18-206ENST00000462976 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
CDK18-206ENST00000462976 OSCARQ8IYS5 282 aa42.71■■■■■ 4.43
CDK18-206ENST00000462976 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
CDK18-206ENST00000462976 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.65■■■■■ 4.42
CDK18-206ENST00000462976 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
CDK18-206ENST00000462976 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.47■■■■■ 4.39
CDK18-206ENST00000462976 CUX1P39880 1505 aa42.46■■■■■ 4.39
CDK18-206ENST00000462976 SOGA1O94964 1423 aa42.46■■■■■ 4.39
CDK18-206ENST00000462976 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.44■■■■■ 4.38
CDK18-206ENST00000462976 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.43■■■■■ 4.38
CDK18-206ENST00000462976 WDR97A6NE52 1622 aa42.33■■■■■ 4.37
CDK18-206ENST00000462976 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
CDK18-206ENST00000462976 TRIM41Q8WV44 630 aa42.27■■■■■ 4.36
CDK18-206ENST00000462976 CHD1O14646 1710 aa42.19■■■■■ 4.34
CDK18-206ENST00000462976 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.07■■■■■ 4.33
CDK18-206ENST00000462976 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.07■■■■■ 4.33
CDK18-206ENST00000462976 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.07■■■■■ 4.33
CDK18-206ENST00000462976 FBLN2P98095 1184 aa42.07■■■■■ 4.33
CDK18-206ENST00000462976 GRIN2BQ13224 1484 aa42.06■■■■■ 4.32
CDK18-206ENST00000462976 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.06■■■■■ 4.32
CDK18-206ENST00000462976 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
CDK18-206ENST00000462976 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.02■■■■■ 4.32
CDK18-206ENST00000462976 ARHGEF11O15085 1522 aa42.01■■■■■ 4.32
CDK18-206ENST00000462976 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.96■■■■■ 4.31
CDK18-206ENST00000462976 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.96■■■■■ 4.31
CDK18-206ENST00000462976 TOP2BQ02880 1626 aa41.95■■■■■ 4.31
CDK18-206ENST00000462976 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.95■■■■■ 4.31
CDK18-206ENST00000462976 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.9■■■■■ 4.3
CDK18-206ENST00000462976 PBRM1Q86U86 1689 aa41.9■■■■■ 4.3
CDK18-206ENST00000462976 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
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CDK18-206ENST00000462976 SYNJ1O43426 1573 aa41.87■■■■■ 4.29
CDK18-206ENST00000462976 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.75■■■■■ 4.27
CDK18-206ENST00000462976 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.62■■■■■ 4.25
CDK18-206ENST00000462976 ARAP1Q96P48 1450 aa41.61■■■■■ 4.25
CDK18-206ENST00000462976 ADAMTS12P58397 1594 aa41.54■■■■■ 4.24
CDK18-206ENST00000462976 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.52■■■■■ 4.24
CDK18-206ENST00000462976 GRIN2AQ12879 1464 aa41.51■■■■■ 4.24
CDK18-206ENST00000462976 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.46■■■■■ 4.23
CDK18-206ENST00000462976 NUP160Q12769 1436 aa41.37■■■■■ 4.21
CDK18-206ENST00000462976 CEP170Q5SW79 1584 aa41.31■■■■■ 4.2
CDK18-206ENST00000462976 KIF27Q86VH2 1401 aa41.15■■■■■ 4.18
CDK18-206ENST00000462976 SHROOM2Q13796 1616 aa41.14■■■■■ 4.18
CDK18-206ENST00000462976 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.07■■■■■ 4.16
CDK18-206ENST00000462976 IGF1RP08069 1367 aa41.06■■■■■ 4.16
CDK18-206ENST00000462976 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
CDK18-206ENST00000462976 CUL7Q14999 1698 aa41■■■■■ 4.15
CDK18-206ENST00000462976 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.94■■■■■ 4.14
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