RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335356.7

GIT1-202, Transcript of GIT ArfGAP 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIT1, Length 660 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1-202ENST00000335356 NISCHQ9Y2I1 1504 aa70.35■■■■■ 8.85
GIT1-202ENST00000335356 ABCC9O60706 1549 aa63.16■■■■■ 7.7
GIT1-202ENST00000335356 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa63.03■■■■■ 7.68
GIT1-202ENST00000335356 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60.07■■■■■ 7.21
GIT1-202ENST00000335356 NACADO15069 1562 aa59.69■■■■■ 7.15
GIT1-202ENST00000335356 DCAF8L2P0C7V8 631 aa59.5■■■■■ 7.12
GIT1-202ENST00000335356 DNAJC5BQ9UF47 199 aa59.37■■■■■ 7.09
GIT1-202ENST00000335356 MYO15BQ96JP2 1530 aa58.88■■■■■ 7.02
GIT1-202ENST00000335356 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP58.88■■■■■ 7.02
GIT1-202ENST00000335356 UNC13AQ9UPW8 1703 aa58.62■■■■■ 6.97
GIT1-202ENST00000335356 BICRAQ9NZM4 1560 aa58.32■■■■■ 6.93
GIT1-202ENST00000335356 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP58.26■■■■■ 6.92
GIT1-202ENST00000335356 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa58.11■■■■■ 6.89
GIT1-202ENST00000335356 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa57.56■■■■■ 6.81
GIT1-202ENST00000335356 SCRIBQ14160 1630 aa57.45■■■■■ 6.79
GIT1-202ENST00000335356 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa57.01■■■■■ 6.72
GIT1-202ENST00000335356 CECR2Q9BXF3 1484 aa56.91■■■■■ 6.7
GIT1-202ENST00000335356 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP56.89■■■■■ 6.7
GIT1-202ENST00000335356 NCAPD3P42695 1498 aa55.16■■■■■ 6.42
GIT1-202ENST00000335356 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.97■■■■■ 6.39
GIT1-202ENST00000335356 SMARCA4P51532 1647 aa54.82■■■■■ 6.37
GIT1-202ENST00000335356 SMARCA2P51531 1590 aa54.77■■■■■ 6.36
GIT1-202ENST00000335356 HMGXB3Q12766 1538 aa54.66■■■■■ 6.34
GIT1-202ENST00000335356 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP54.59■■■■■ 6.33
GIT1-202ENST00000335356 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa54.56■■■■■ 6.32
GIT1-202ENST00000335356 ERCC6Q03468 1493 aa54.54■■■■■ 6.32
GIT1-202ENST00000335356 CUX2O14529 1486 aa54.45■■■■■ 6.31
GIT1-202ENST00000335356 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP54.4■■■■■ 6.3
GIT1-202ENST00000335356 PEG3Q9GZU2 1588 aa54.32■■■■■ 6.29
GIT1-202ENST00000335356 NESP48681 1621 aa54.24■■■■■ 6.27
GIT1-202ENST00000335356 MROH2BQ7Z745 1585 aa54.2■■■■■ 6.27
GIT1-202ENST00000335356 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa53.84■■■■■ 6.21
GIT1-202ENST00000335356 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53.61■■■■■ 6.17
GIT1-202ENST00000335356 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.61■■■■■ 6.17
GIT1-202ENST00000335356 CADPSQ9ULU8 1353 aa53.5■■■■■ 6.16
GIT1-202ENST00000335356 WIZO95785 1651 aa53.5■■■■■ 6.15
GIT1-202ENST00000335356 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.44■■■■■ 6.15
GIT1-202ENST00000335356 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP53.11■■■■■ 6.09
GIT1-202ENST00000335356 MRC2Q9UBG0 1479 aa53.09■■■■■ 6.09
GIT1-202ENST00000335356 WDR62O43379 1518 aa52.93■■■■■ 6.06
GIT1-202ENST00000335356 CEP164Q9UPV0 1460 aa52.88■■■■■ 6.06
GIT1-202ENST00000335356 CFTRP13569 1480 aa52.85■■■■■ 6.05
GIT1-202ENST00000335356 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP52.84■■■■■ 6.05
GIT1-202ENST00000335356 FANCD2Q9BXW9 1451 aa52.83■■■■■ 6.05
GIT1-202ENST00000335356 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP52.39■■■■■ 5.98
GIT1-202ENST00000335356 CCDC88BA6NC98 1476 aa52.31■■■■■ 5.96
GIT1-202ENST00000335356 PRDM2Q13029 1718 aa52.15■■■■■ 5.94
GIT1-202ENST00000335356 TRIM41Q8WV44 630 aa52.11■■■■■ 5.93
GIT1-202ENST00000335356 OSCARQ8IYS5 282 aa52.08■■■■■ 5.93
GIT1-202ENST00000335356 IFT140Q96RY7 1462 aa51.86■■■■■ 5.89
GIT1-202ENST00000335356 TOPBP1Q92547 1522 aa51.83■■■■■ 5.89
GIT1-202ENST00000335356 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP51.76■■■■■ 5.88
GIT1-202ENST00000335356 ABCC8Q09428 1581 aa51.75■■■■■ 5.88
GIT1-202ENST00000335356 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51.6■■■■■ 5.85
GIT1-202ENST00000335356 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP51.38■■■■■ 5.82
GIT1-202ENST00000335356 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP51.32■■■■■ 5.81
GIT1-202ENST00000335356 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP51.32■■■■■ 5.81
GIT1-202ENST00000335356 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP51.29■■■■■ 5.8
GIT1-202ENST00000335356 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa51.24■■■■■ 5.79
GIT1-202ENST00000335356 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa51.24■■■■■ 5.79
GIT1-202ENST00000335356 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa51.24■■■■■ 5.79
GIT1-202ENST00000335356 SOGA1O94964 1423 aa51.13■■■■■ 5.77
GIT1-202ENST00000335356 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa51.12■■■■■ 5.77
GIT1-202ENST00000335356 ARHGEF11O15085 1522 aa51.11■■■■■ 5.77
GIT1-202ENST00000335356 FBLN2P98095 1184 aa51.04■■■■■ 5.76
GIT1-202ENST00000335356 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP51.03■■■■■ 5.76
GIT1-202ENST00000335356 CHD1O14646 1710 aa50.99■■■■■ 5.75
GIT1-202ENST00000335356 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.96■■■■■ 5.75
GIT1-202ENST00000335356 CUX1P39880 1505 aa50.91■■■■■ 5.74
GIT1-202ENST00000335356 CYB5RLQ6IPT4 315 aa50.85■■■■■ 5.73
GIT1-202ENST00000335356 WDR97A6NE52 1622 aa50.8■■■■■ 5.72
GIT1-202ENST00000335356 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.8■■■■■ 5.72
GIT1-202ENST00000335356 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa50.75■■■■■ 5.71
GIT1-202ENST00000335356 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP50.67■■■■■ 5.7
GIT1-202ENST00000335356 GRIN2BQ13224 1484 aa50.65■■■■■ 5.7
GIT1-202ENST00000335356 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP50.63■■■■■ 5.7
GIT1-202ENST00000335356 ARAP1Q96P48 1450 aa50.61■■■■■ 5.69
GIT1-202ENST00000335356 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.46■■■■■ 5.67
GIT1-202ENST00000335356 SYNJ2O15056 1496 aa50.46■■■■■ 5.67
GIT1-202ENST00000335356 GAPVD1Q14C86 1478 aa50.46■■■■■ 5.67
GIT1-202ENST00000335356 SYNJ1O43426 1573 aa50.44■■■■■ 5.67
GIT1-202ENST00000335356 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.41■■■■■ 5.66
GIT1-202ENST00000335356 PBRM1Q86U86 1689 aa50.31■■■■■ 5.64
GIT1-202ENST00000335356 TRHP20396 242 aaPredicted RBP50.27■■■■■ 5.64
GIT1-202ENST00000335356 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.25■■■■■ 5.64
GIT1-202ENST00000335356 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP50.23■■■■■ 5.63
GIT1-202ENST00000335356 TOP2BQ02880 1626 aa50.07■■■■■ 5.61
GIT1-202ENST00000335356 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.03■■■■■ 5.6
GIT1-202ENST00000335356 GRIN2AQ12879 1464 aa49.96■■■■■ 5.59
GIT1-202ENST00000335356 ADAMTS12P58397 1594 aa49.87■■■■■ 5.57
GIT1-202ENST00000335356 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.84■■■■■ 5.57
GIT1-202ENST00000335356 NUP160Q12769 1436 aa49.83■■■■■ 5.57
GIT1-202ENST00000335356 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.75■■■■■ 5.56
GIT1-202ENST00000335356 CEP170Q5SW79 1584 aa49.75■■■■■ 5.55
GIT1-202ENST00000335356 ERCC6L2Q5T890 1561 aa49.68■■■■■ 5.54
GIT1-202ENST00000335356 SHROOM2Q13796 1616 aa49.54■■■■■ 5.52
GIT1-202ENST00000335356 JPH4Q96JJ6 628 aa49.42■■■■■ 5.5
GIT1-202ENST00000335356 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.36■■■■■ 5.49
GIT1-202ENST00000335356 IGF1RP08069 1367 aa49.21■■■■■ 5.47
GIT1-202ENST00000335356 KIF27Q86VH2 1401 aa49.17■■■■■ 5.46
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