Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTA1Q13330 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTA1Q13330 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
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