Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNC1P63316 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNC1P63316 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms