Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A11P48066 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms