Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCIP41743 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCIP41743 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms