Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.063e-9■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.083e-9■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.113e-9■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.313e-9■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.417e-7■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.017e-7■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 WDR27-211ENST00000546525 3511 ntTSL 1 (best)14.38□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 WDR27-202ENST00000441385 683 ntTSL 314.37□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 TBKBP1-203ENST00000578982 733 ntTSL 321.4■■□□□ 1.024e-8■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.569e-7■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 PFKFB4-214ENST00000490404 849 ntTSL 310.66□□□□□ -0.75e-8■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.871e-13■■■■■ 36.9
GTF2F1P35269 ZC3H8-207ENST00000495264 319 ntTSL 28.4□□□□□ -1.062e-9■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 MKLN1-208ENST00000494286 582 ntTSL 420.33■□□□□ 0.852e-9■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 MKLN1-205ENST00000446815 551 ntTSL 419.99■□□□□ 0.792e-9■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.222e-9■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 MKLN1-209ENST00000494785 2386 ntTSL 1 (best)11.59□□□□□ -0.552e-9■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 MKLN1-206ENST00000458153 2448 ntTSL 210.57□□□□□ -0.722e-9■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 MKLN1-202ENST00000416992 864 ntTSL 39.63□□□□□ -0.872e-9■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.222e-9■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.822e-9■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.179e-7■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.319e-7■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.49e-7■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 LRRC41-205ENST00000498402 2068 ntTSL 220.04■□□□□ 0.84e-7■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.384e-7■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 LRRC41-207ENST00000617190 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 GTF2IP20-203ENST00000634905 2966 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.196e-8■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 DOCK11-202ENST00000276204 6664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.993e-7■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.253e-7■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 AP3D1-209ENST00000591284 580 ntTSL 521.35■■□□□ 1.011e-14■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.711e-14■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.671e-14■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 C16orf95-202ENST00000562840 1650 ntTSL 219.24■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 36.8
GTF2F1P35269 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.183e-7■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 ZFAND3-207ENST00000474522 563 ntTSL 58.39□□□□□ -1.073e-7■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.758e-9■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.538e-9■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 FKBP8-203ENST00000594844 593 ntTSL 423.94■■□□□ 1.428e-9■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 FKBP8-202ENST00000544835 1292 ntTSL 1 (best)20.4■□□□□ 0.868e-9■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 FKBP8-207ENST00000597547 574 ntTSL 318.64■□□□□ 0.578e-9■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 FKBP8-211ENST00000601844 1548 ntTSL 518.49■□□□□ 0.558e-9■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.58e-9■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 FKBP8-208ENST00000597611 966 ntTSL 317■□□□□ 0.318e-9■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 FKBP8-214ENST00000609656 220 ntTSL 26.9□□□□□ -1.38e-9■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 WDR6-214ENST00000488572 610 ntTSL 423.01■■□□□ 1.272e-8■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 WDR6-213ENST00000473238 568 ntTSL 320.79■□□□□ 0.922e-8■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 WDR6-206ENST00000438660 852 ntTSL 520.29■□□□□ 0.842e-8■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.82e-8■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 WDR6-205ENST00000429900 563 ntTSL 518.94■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 WDR6-212ENST00000472878 556 ntTSL 518.62■□□□□ 0.572e-8■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 WDR6-209ENST00000461687 555 ntTSL 417.15■□□□□ 0.342e-8■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 WDR6-210ENST00000462064 589 ntTSL 516.83■□□□□ 0.282e-8■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 WDR6-203ENST00000419837 538 ntTSL 412.39□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.165e-7■■■■■ 36.7
GTF2F1P35269 SS18L1-203ENST00000450482 781 ntTSL 513.25□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 36.6
GTF2F1P35269 SS18L1-201ENST00000331758 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 36.6
GTF2F1P35269 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.886e-7■■■■■ 36.6
GTF2F1P35269 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.816e-7■■■■■ 36.6
GTF2F1P35269 R3HDM4-204ENST00000589428 1704 ntTSL 322.77■■□□□ 1.246e-7■■■■■ 36.6
GTF2F1P35269 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.015e-8■■■■■ 36.6
GTF2F1P35269 MGMT-203ENST00000482547 959 ntTSL 213.76□□□□□ -0.214e-10■■■■■ 36.6
GTF2F1P35269 SMARCD1-209ENST00000550477 911 ntTSL 326.14■■□□□ 1.786e-17■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 SMARCD1-204ENST00000547637 587 ntTSL 226.14■■□□□ 1.786e-17■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 SMARCD1-212ENST00000551966 881 ntTSL 524.99■■□□□ 1.596e-17■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 SMARCD1-203ENST00000547247 1584 ntTSL 1 (best)24.72■■□□□ 1.556e-17■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.316e-17■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.085e-7■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.675e-7■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.475e-7■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.376e-17■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 SMARCD1-211ENST00000551497 536 ntTSL 416.4■□□□□ 0.226e-17■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.632e-34■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 LMNB1-203ENST00000460265 3475 ntTSL 1 (best)18.02■□□□□ 0.472e-34■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 MBNL2-206ENST00000469707 2574 ntTSL 1 (best)9.85□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.222e-7■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.282e-7■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.541e-70■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.039e-8■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 PPP2R2D-207ENST00000616467 2058 ntTSL 1 (best)26.59■■□□□ 1.852e-8■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.632e-8■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 PPP2R2D-204ENST00000482010 1792 ntTSL 219.52■□□□□ 0.712e-8■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 PPP2R2D-205ENST00000490777 1462 ntTSL 1 (best)18.52■□□□□ 0.555e-24■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 PPP2R2D-202ENST00000470416 6203 ntTSL 1 (best)12.83□□□□□ -0.362e-8■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.24e-9■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 ZC3H8-203ENST00000464305 554 ntTSL 58.92□□□□□ -0.984e-9■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.14e-9■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.24e-9■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 ZC3H8-205ENST00000474234 847 ntTSL 57.23□□□□□ -1.254e-9■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 FAM222B-203ENST00000577376 720 ntTSL 227.24■■□□□ 1.951e-10■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.921e-10■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.561e-10■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 FAM222B-206ENST00000579381 462 ntTSL 524.75■■□□□ 1.551e-10■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.551e-10■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 FAM222B-207ENST00000581229 598 ntTSL 423.37■■□□□ 1.331e-10■■■■■ 36.5
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 85.4 ms