Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN7P35236 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN7P35236 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms