Protein–RNA interactions for Protein: P05813

CRYBA1, Beta-crystallin A3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA1P05813 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRYBA1P05813 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRYBA1P05813 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms