Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBG1P69891 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBG1P69891 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBG1P69891 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBG1P69891 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBG1P69891 KLLN-201ENST00000445946 4277 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBG1P69891 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HBG1P69891 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBG1P69891 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBG1P69891 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBG1P69891 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBG1P69891 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBG1P69891 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 ARHGAP20-202ENST00000524756 6180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 LOXHD1-210ENST00000536736 6848 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 NLRP1-202ENST00000269280 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBG1P69891 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 CASP8AP2-205ENST00000551025 6151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBG1P69891 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms