Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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