Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 FYCO1-201ENST00000296137 8504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC009084.2-201ENST00000624046 2810 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 C8orf17-202ENST00000625034 2775 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms