Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CLCN4-202ENST00000380833 6750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CHST6-201ENST00000332272 7957 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 YY2-201ENST00000429584 2741 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms