Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BOLA3Q53S33 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
BOLA3Q53S33 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BOLA3Q53S33 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BOLA3Q53S33 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BOLA3Q53S33 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BOLA3Q53S33 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BOLA3Q53S33 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
BOLA3Q53S33 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
BOLA3Q53S33 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BOLA3Q53S33 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BOLA3Q53S33 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BOLA3Q53S33 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms