Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNAP12004 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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