Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX8Q9HC52 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms