Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXD4L6Q3SYB3 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms