Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ACTBP60709 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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ACTBP60709 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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ACTBP60709 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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ACTBP60709 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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ACTBP60709 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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ACTBP60709 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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ACTBP60709 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ACTBP60709 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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ACTBP60709 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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