Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RPL19P20-201ENST00000415648 591 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 AC009237.11-201ENST00000425635 265 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 RPSAP46-201ENST00000428316 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 AC074366.1-204ENST00000446277 552 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 AC018892.1-201ENST00000451098 265 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 PRAMEF35P-201ENST00000458709 891 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 RAET1G-203ENST00000479265 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 OR10V2P-201ENST00000525296 764 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 AC127537.3-201ENST00000566532 749 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 AC087893.1-201ENST00000612818 664 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 APTX-206ENST00000379825 2023 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NESP48681 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 AP000925.1-201ENST00000425960 1449 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 RARRES3-202ENST00000354445 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 CFAP36-205ENST00000407816 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 AC018511.1-201ENST00000436608 380 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 AL390726.1-201ENST00000451357 202 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 SLC22A18AS-201ENST00000455942 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 RN7SL733P-201ENST00000582253 329 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 ZNF544-209ENST00000596929 543 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 RN7SL248P-201ENST00000615117 329 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 RN7SL453P-201ENST00000620275 329 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 AC092471.1-202ENST00000637160 999 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 M1AP-201ENST00000290536 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NESP48681 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 PRKCE-202ENST00000394874 996 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 AC016735.1-201ENST00000457457 237 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 AC091893.1-201ENST00000503772 399 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 LINC02163-201ENST00000514769 574 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 IGHV3-60-201ENST00000521678 354 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 MAF1-204ENST00000532522 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 LINC02074-201ENST00000581028 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 LINC02074-202ENST00000584003 573 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 LINC02340-202ENST00000620494 573 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 HFE-204ENST00000349999 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 CD33-202ENST00000391796 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 TMX3-202ENST00000443099 913 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 RPLP0P2-204ENST00000490750 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 AL049871.1-201ENST00000557475 880 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 AC109826.1-203ENST00000624259 1105 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 SPDL1-216ENST00000629457 340 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NESP48681 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NESP48681 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NESP48681 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NESP48681 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.9 ms