Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 EIF4A1-225ENST00000582746 1645 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AL512444.1-201ENST00000419644 480 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AP000346.2-201ENST00000430707 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC110285.1-201ENST00000572077 665 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRXP46100 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 FATE1-201ENST00000370350 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 MRPL55-213ENST00000366740 644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 HNRNPA1P34-201ENST00000391992 950 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 C3orf18-202ENST00000422619 551 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 NDFIP2-AS1-201ENST00000457171 431 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC134312.5-202ENST00000562705 756 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 FAM90A27P-201ENST00000593323 1370 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 FAM90A28P-202ENST00000597191 1374 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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