RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445739.1

RPSAP69-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 69, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene RPSAP69, Length 546 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP69-201ENST00000445739 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.11■■■□□ 2.73
RPSAP69-201ENST00000445739 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.56■■■□□ 2.16
RPSAP69-201ENST00000445739 ABCC9O60706 1549 aa28.06■■■□□ 2.08
RPSAP69-201ENST00000445739 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
RPSAP69-201ENST00000445739 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.01■■□□□ 1.91
RPSAP69-201ENST00000445739 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.93■■□□□ 1.9
RPSAP69-201ENST00000445739 NACADO15069 1562 aa26.86■■□□□ 1.89
RPSAP69-201ENST00000445739 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
RPSAP69-201ENST00000445739 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.63■■□□□ 1.85
RPSAP69-201ENST00000445739 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.51■■□□□ 1.83
RPSAP69-201ENST00000445739 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.34■■□□□ 1.81
RPSAP69-201ENST00000445739 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.25■■□□□ 1.79
RPSAP69-201ENST00000445739 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.79
RPSAP69-201ENST00000445739 SCRIBQ14160 1630 aa26.13■■□□□ 1.77
RPSAP69-201ENST00000445739 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.07■■□□□ 1.76
RPSAP69-201ENST00000445739 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.75■■□□□ 1.71
RPSAP69-201ENST00000445739 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.74■■□□□ 1.71
RPSAP69-201ENST00000445739 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
RPSAP69-201ENST00000445739 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.34■■□□□ 1.65
RPSAP69-201ENST00000445739 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.18■■□□□ 1.62
RPSAP69-201ENST00000445739 SMARCA4P51532 1647 aa24.94■■□□□ 1.58
RPSAP69-201ENST00000445739 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
RPSAP69-201ENST00000445739 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.8■■□□□ 1.56
RPSAP69-201ENST00000445739 SMARCA2P51531 1590 aa24.78■■□□□ 1.56
RPSAP69-201ENST00000445739 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.77■■□□□ 1.56
RPSAP69-201ENST00000445739 NCAPD3P42695 1498 aa24.77■■□□□ 1.56
RPSAP69-201ENST00000445739 HMGXB3Q12766 1538 aa24.65■■□□□ 1.54
RPSAP69-201ENST00000445739 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.64■■□□□ 1.54
RPSAP69-201ENST00000445739 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
RPSAP69-201ENST00000445739 WIZO95785 1651 aa24.53■■□□□ 1.52
RPSAP69-201ENST00000445739 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
RPSAP69-201ENST00000445739 NESP48681 1621 aa24.24■■□□□ 1.47
RPSAP69-201ENST00000445739 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
RPSAP69-201ENST00000445739 ERCC6Q03468 1493 aa24.2■■□□□ 1.47
RPSAP69-201ENST00000445739 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.16■■□□□ 1.46
RPSAP69-201ENST00000445739 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.07■■□□□ 1.44
RPSAP69-201ENST00000445739 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.01■■□□□ 1.43
RPSAP69-201ENST00000445739 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.97■■□□□ 1.43
RPSAP69-201ENST00000445739 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.96■■□□□ 1.43
RPSAP69-201ENST00000445739 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
RPSAP69-201ENST00000445739 CFTRP13569 1480 aa23.9■■□□□ 1.42
RPSAP69-201ENST00000445739 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
RPSAP69-201ENST00000445739 CUX2O14529 1486 aa23.88■■□□□ 1.41
RPSAP69-201ENST00000445739 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
RPSAP69-201ENST00000445739 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.82■■□□□ 1.4
RPSAP69-201ENST00000445739 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.8■■□□□ 1.4
RPSAP69-201ENST00000445739 PRDM2Q13029 1718 aa23.76■■□□□ 1.39
RPSAP69-201ENST00000445739 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.76■■□□□ 1.39
RPSAP69-201ENST00000445739 WDR62O43379 1518 aa23.65■■□□□ 1.38
RPSAP69-201ENST00000445739 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
RPSAP69-201ENST00000445739 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
RPSAP69-201ENST00000445739 TOPBP1Q92547 1522 aa23.43■■□□□ 1.34
RPSAP69-201ENST00000445739 ABCC8Q09428 1581 aa23.41■■□□□ 1.34
RPSAP69-201ENST00000445739 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.4■■□□□ 1.34
RPSAP69-201ENST00000445739 IFT140Q96RY7 1462 aa23.29■■□□□ 1.32
RPSAP69-201ENST00000445739 CUX1P39880 1505 aa23.23■■□□□ 1.31
RPSAP69-201ENST00000445739 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
RPSAP69-201ENST00000445739 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.2■■□□□ 1.3
RPSAP69-201ENST00000445739 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
RPSAP69-201ENST00000445739 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.18■■□□□ 1.3
RPSAP69-201ENST00000445739 SOGA1O94964 1423 aa23.16■■□□□ 1.3
RPSAP69-201ENST00000445739 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
RPSAP69-201ENST00000445739 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.15■■□□□ 1.3
RPSAP69-201ENST00000445739 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
RPSAP69-201ENST00000445739 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
RPSAP69-201ENST00000445739 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
RPSAP69-201ENST00000445739 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
RPSAP69-201ENST00000445739 SYNJ1O43426 1573 aa23.03■■□□□ 1.28
RPSAP69-201ENST00000445739 TOP2BQ02880 1626 aa23.02■■□□□ 1.28
RPSAP69-201ENST00000445739 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.02■■□□□ 1.28
RPSAP69-201ENST00000445739 WDR97A6NE52 1622 aa22.97■■□□□ 1.27
RPSAP69-201ENST00000445739 OSCARQ8IYS5 282 aa22.94■■□□□ 1.26
RPSAP69-201ENST00000445739 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.92■■□□□ 1.26
RPSAP69-201ENST00000445739 FBLN2P98095 1184 aa22.89■■□□□ 1.25
RPSAP69-201ENST00000445739 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.87■■□□□ 1.25
RPSAP69-201ENST00000445739 GRIN2BQ13224 1484 aa22.86■■□□□ 1.25
RPSAP69-201ENST00000445739 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.86■■□□□ 1.25
RPSAP69-201ENST00000445739 CHD1O14646 1710 aa22.85■■□□□ 1.25
RPSAP69-201ENST00000445739 PBRM1Q86U86 1689 aa22.85■■□□□ 1.25
RPSAP69-201ENST00000445739 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.83■■□□□ 1.25
RPSAP69-201ENST00000445739 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
RPSAP69-201ENST00000445739 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RPSAP69-201ENST00000445739 SYNJ2O15056 1496 aa22.72■■□□□ 1.23
RPSAP69-201ENST00000445739 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.65■■□□□ 1.22
RPSAP69-201ENST00000445739 ADAMTS12P58397 1594 aa22.63■■□□□ 1.21
RPSAP69-201ENST00000445739 KIF27Q86VH2 1401 aa22.61■■□□□ 1.21
RPSAP69-201ENST00000445739 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.6■■□□□ 1.21
RPSAP69-201ENST00000445739 TRIM41Q8WV44 630 aa22.58■■□□□ 1.21
RPSAP69-201ENST00000445739 GRIN2AQ12879 1464 aa22.57■■□□□ 1.2
RPSAP69-201ENST00000445739 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.57■■□□□ 1.2
RPSAP69-201ENST00000445739 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.57■■□□□ 1.2
RPSAP69-201ENST00000445739 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.57■■□□□ 1.2
RPSAP69-201ENST00000445739 ARHGEF11O15085 1522 aa22.54■■□□□ 1.2
RPSAP69-201ENST00000445739 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.54■■□□□ 1.2
RPSAP69-201ENST00000445739 IGF1RP08069 1367 aa22.5■■□□□ 1.19
RPSAP69-201ENST00000445739 CEP170Q5SW79 1584 aa22.46■■□□□ 1.19
RPSAP69-201ENST00000445739 CUL7Q14999 1698 aa22.46■■□□□ 1.19
RPSAP69-201ENST00000445739 NUP160Q12769 1436 aa22.44■■□□□ 1.18
RPSAP69-201ENST00000445739 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.41■■□□□ 1.18
RPSAP69-201ENST00000445739 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms