RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592312.5

ECSIT-211, Transcript of ECSIT signalling integrator, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ECSIT, Length 1,286 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSIT-211ENST00000592312 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.93■■■□□ 2.7
ECSIT-211ENST00000592312 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.49■■■□□ 2.15
ECSIT-211ENST00000592312 ABCC9O60706 1549 aa27.97■■■□□ 2.07
ECSIT-211ENST00000592312 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.91■■□□□ 1.9
ECSIT-211ENST00000592312 NACADO15069 1562 aa26.85■■□□□ 1.89
ECSIT-211ENST00000592312 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.7■■□□□ 1.86
ECSIT-211ENST00000592312 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.67■■□□□ 1.86
ECSIT-211ENST00000592312 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
ECSIT-211ENST00000592312 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.48■■□□□ 1.83
ECSIT-211ENST00000592312 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.2■■□□□ 1.79
ECSIT-211ENST00000592312 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
ECSIT-211ENST00000592312 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.05■■□□□ 1.76
ECSIT-211ENST00000592312 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.9■■□□□ 1.74
ECSIT-211ENST00000592312 SCRIBQ14160 1630 aa25.88■■□□□ 1.73
ECSIT-211ENST00000592312 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.84■■□□□ 1.73
ECSIT-211ENST00000592312 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
ECSIT-211ENST00000592312 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.32■■□□□ 1.64
ECSIT-211ENST00000592312 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.2■■□□□ 1.62
ECSIT-211ENST00000592312 SMARCA4P51532 1647 aa24.79■■□□□ 1.56
ECSIT-211ENST00000592312 NCAPD3P42695 1498 aa24.78■■□□□ 1.56
ECSIT-211ENST00000592312 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
ECSIT-211ENST00000592312 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.73■■□□□ 1.55
ECSIT-211ENST00000592312 SMARCA2P51531 1590 aa24.71■■□□□ 1.55
ECSIT-211ENST00000592312 HMGXB3Q12766 1538 aa24.63■■□□□ 1.53
ECSIT-211ENST00000592312 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.62■■□□□ 1.53
ECSIT-211ENST00000592312 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.55■■□□□ 1.52
ECSIT-211ENST00000592312 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
ECSIT-211ENST00000592312 WIZO95785 1651 aa24.26■■□□□ 1.47
ECSIT-211ENST00000592312 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
ECSIT-211ENST00000592312 ERCC6Q03468 1493 aa24.16■■□□□ 1.46
ECSIT-211ENST00000592312 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.15■■□□□ 1.46
ECSIT-211ENST00000592312 NESP48681 1621 aa24.13■■□□□ 1.45
ECSIT-211ENST00000592312 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
ECSIT-211ENST00000592312 CUX2O14529 1486 aa24.04■■□□□ 1.44
ECSIT-211ENST00000592312 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.03■■□□□ 1.44
ECSIT-211ENST00000592312 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24■■□□□ 1.43
ECSIT-211ENST00000592312 CFTRP13569 1480 aa23.85■■□□□ 1.41
ECSIT-211ENST00000592312 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
ECSIT-211ENST00000592312 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.85■■□□□ 1.41
ECSIT-211ENST00000592312 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.75■■□□□ 1.39
ECSIT-211ENST00000592312 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.73■■□□□ 1.39
ECSIT-211ENST00000592312 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.73■■□□□ 1.39
ECSIT-211ENST00000592312 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.72■■□□□ 1.39
ECSIT-211ENST00000592312 WDR62O43379 1518 aa23.66■■□□□ 1.38
ECSIT-211ENST00000592312 PRDM2Q13029 1718 aa23.61■■□□□ 1.37
ECSIT-211ENST00000592312 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.51■■□□□ 1.35
ECSIT-211ENST00000592312 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ECSIT-211ENST00000592312 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ECSIT-211ENST00000592312 ABCC8Q09428 1581 aa23.4■■□□□ 1.34
ECSIT-211ENST00000592312 TOPBP1Q92547 1522 aa23.32■■□□□ 1.32
ECSIT-211ENST00000592312 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.29■■□□□ 1.32
ECSIT-211ENST00000592312 IFT140Q96RY7 1462 aa23.26■■□□□ 1.31
ECSIT-211ENST00000592312 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
ECSIT-211ENST00000592312 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
ECSIT-211ENST00000592312 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
ECSIT-211ENST00000592312 CUX1P39880 1505 aa23.05■■□□□ 1.28
ECSIT-211ENST00000592312 SOGA1O94964 1423 aa23.03■■□□□ 1.28
ECSIT-211ENST00000592312 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.01■■□□□ 1.27
ECSIT-211ENST00000592312 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
ECSIT-211ENST00000592312 OSCARQ8IYS5 282 aa22.99■■□□□ 1.27
ECSIT-211ENST00000592312 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.98■■□□□ 1.27
ECSIT-211ENST00000592312 WDR97A6NE52 1622 aa22.97■■□□□ 1.27
ECSIT-211ENST00000592312 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
ECSIT-211ENST00000592312 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
ECSIT-211ENST00000592312 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
ECSIT-211ENST00000592312 TOP2BQ02880 1626 aa22.83■■□□□ 1.25
ECSIT-211ENST00000592312 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.83■■□□□ 1.25
ECSIT-211ENST00000592312 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.82■■□□□ 1.24
ECSIT-211ENST00000592312 GRIN2BQ13224 1484 aa22.79■■□□□ 1.24
ECSIT-211ENST00000592312 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
ECSIT-211ENST00000592312 SYNJ1O43426 1573 aa22.76■■□□□ 1.23
ECSIT-211ENST00000592312 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.75■■□□□ 1.23
ECSIT-211ENST00000592312 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.74■■□□□ 1.23
ECSIT-211ENST00000592312 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.72■■□□□ 1.23
ECSIT-211ENST00000592312 CHD1O14646 1710 aa22.72■■□□□ 1.23
ECSIT-211ENST00000592312 FBLN2P98095 1184 aa22.7■■□□□ 1.22
ECSIT-211ENST00000592312 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ECSIT-211ENST00000592312 PBRM1Q86U86 1689 aa22.67■■□□□ 1.22
ECSIT-211ENST00000592312 SYNJ2O15056 1496 aa22.66■■□□□ 1.22
ECSIT-211ENST00000592312 ARHGEF11O15085 1522 aa22.58■■□□□ 1.21
ECSIT-211ENST00000592312 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.58■■□□□ 1.21
ECSIT-211ENST00000592312 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.58■■□□□ 1.21
ECSIT-211ENST00000592312 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.58■■□□□ 1.21
ECSIT-211ENST00000592312 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.56■■□□□ 1.2
ECSIT-211ENST00000592312 TRIM41Q8WV44 630 aa22.55■■□□□ 1.2
ECSIT-211ENST00000592312 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.53■■□□□ 1.2
ECSIT-211ENST00000592312 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.51■■□□□ 1.19
ECSIT-211ENST00000592312 ADAMTS12P58397 1594 aa22.5■■□□□ 1.19
ECSIT-211ENST00000592312 GRIN2AQ12879 1464 aa22.48■■□□□ 1.19
ECSIT-211ENST00000592312 KIF27Q86VH2 1401 aa22.42■■□□□ 1.18
ECSIT-211ENST00000592312 NUP160Q12769 1436 aa22.4■■□□□ 1.18
ECSIT-211ENST00000592312 ARAP1Q96P48 1450 aa22.37■■□□□ 1.17
ECSIT-211ENST00000592312 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.37■■□□□ 1.17
ECSIT-211ENST00000592312 IGF1RP08069 1367 aa22.35■■□□□ 1.17
ECSIT-211ENST00000592312 CEP170Q5SW79 1584 aa22.34■■□□□ 1.17
ECSIT-211ENST00000592312 CUL7Q14999 1698 aa22.3■■□□□ 1.16
ECSIT-211ENST00000592312 SHROOM2Q13796 1616 aa22.25■■□□□ 1.15
ECSIT-211ENST00000592312 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.21■■□□□ 1.15
ECSIT-211ENST00000592312 JPH4Q96JJ6 628 aa22.18■■□□□ 1.14
ECSIT-211ENST00000592312 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms