Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFATC4-212ENST00000554473 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR7E37P-201ENST00000421076 897 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139353.1-202ENST00000547378 474 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02340-202ENST00000620494 573 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL512488.1-201ENST00000433544 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC069503.1-201ENST00000538710 816 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02381-202ENST00000635070 1341 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007312.1-201ENST00000427493 258 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAFTRR-201ENST00000562921 1859 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAX6-255ENST00000639386 1723 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF684-203ENST00000372699 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL592295.4-201ENST00000636161 997 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBB8-207ENST00000568866 1367 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090403.1-201ENST00000584546 1352 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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