Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLR2FP61218 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2FP61218 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC15.05■□□□□ 0
POLR2FP61218 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2FP61218 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2FP61218 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2FP61218 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2FP61218 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2FP61218 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2FP61218 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2FP61218 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2FP61218 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2FP61218 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2FP61218 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2FP61218 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2FP61218 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLR2FP61218 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2FP61218 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2FP61218 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2FP61218 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms