Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFNP31947 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFNP31947 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms