Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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SIX1Q15475 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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SIX1Q15475 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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SIX1Q15475 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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SIX1Q15475 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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SIX1Q15475 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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SIX1Q15475 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SIX1Q15475 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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