Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AC023830.3-201ENST00000612995 1455 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 NHP2-201ENST00000274606 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 MBL3P-201ENST00000402234 644 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 BCRP5-201ENST00000514371 253 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AP003096.1-201ENST00000565199 503 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC006547.1-206ENST00000600617 878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 RSPH1-202ENST00000398352 937 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 RPL7AP53-201ENST00000468834 793 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC025178.1-201ENST00000503441 834 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 SNAPC5-207ENST00000566658 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC022211.3-201ENST00000584339 400 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 NOSIP-204ENST00000596358 1005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 PDLIM1P1-201ENST00000604187 969 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFTRP13569 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 THYN1-202ENST00000352327 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 HNRNPA1P30-202ENST00000440699 997 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 FTLP16-201ENST00000446400 513 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AL929472.4-201ENST00000447422 691 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC022447.2-201ENST00000509750 543 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 HDAC2-AS2-216ENST00000522844 808 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 OR4C3-202ENST00000611380 597 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC009093.9-201ENST00000566038 1611 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC073585.1-201ENST00000368895 1328 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFTRP13569 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CFTRP13569 LINC01115-202ENST00000621134 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CFTRP13569 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 SYCE1-201ENST00000303903 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 WFDC2-202ENST00000339946 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 WFDC2-204ENST00000372676 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 LINC00544-201ENST00000400540 1031 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 EEF1GP1-201ENST00000457231 1299 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AC108082.1-201ENST00000510857 331 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 ASS1P9-201ENST00000513426 1236 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFTRP13569 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms