Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E1

PCDHB9, Protocadherin beta-9, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB9Q9Y5E1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB9Q9Y5E1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms