Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF1Q9NZS2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLRF1Q9NZS2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms