Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC11CQ9BY50 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC11CQ9BY50 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms