Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM2Q9BVW6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms