Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEPDC7Q96QD5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEPDC7Q96QD5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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