Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf47Q6ZRZ4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms