Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASC4Q6P4E1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC4Q6P4E1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms