Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPH2Q6IBW4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPH2Q6IBW4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms