Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.433e-7■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.462e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 PPP1R12C-203ENST00000586197 472 ntTSL 516.56■□□□□ 0.242e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.11e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 MAGOH-201ENST00000371466 500 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.951e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.042e-7■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 ST13-201ENST00000216218 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.687e-7■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 ST13-207ENST00000620312 944 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.097e-7■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 MCM2-203ENST00000468659 557 ntTSL 422.3■■□□□ 1.161e-7■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 MCM2-207ENST00000477668 2510 ntTSL 218.42■□□□□ 0.541e-7■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 MCM2-206ENST00000474964 2847 ntTSL 215.76■□□□□ 0.111e-7■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 MCM2-209ENST00000491422 2844 ntTSL 513.05□□□□□ -0.321e-7■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.41e-7■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 SRRM1-211ENST00000478890 480 ntTSL 32.81□□□□□ -1.961e-10■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.731e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 TJP1-210ENST00000558447 720 ntTSL 325.64■■□□□ 1.71e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.121e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.921e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.881e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 YWHAZ-215ENST00000518736 883 ntTSL 320.46■□□□□ 0.871e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.761e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 TES-208ENST00000492891 1022 ntTSL 218.57■□□□□ 0.561e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.541e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.531e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.471e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.421e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.281e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.271e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 ATP5B-205ENST00000548647 682 ntTSL 516.55■□□□□ 0.241e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.241e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.211e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.191e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.171e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 TMCO1-205ENST00000476143 581 ntTSL 314.4□□□□□ -0.11e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 YWHAZ-214ENST00000517727 876 ntTSL 314.37□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.21e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 EIF3F-205ENST00000531329 1072 ntTSL 213.6□□□□□ -0.231e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.271e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.31e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.311e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.411e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 RNF34-205ENST00000554484 1603 ntTSL 212.31□□□□□ -0.441e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 TMCO1-206ENST00000481278 752 ntTSL 311.92□□□□□ -0.51e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 TMCO1-202ENST00000392129 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.571e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 TMCO1-204ENST00000465705 760 ntTSL 511.14□□□□□ -0.631e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 YWHAZ-217ENST00000521328 511 ntTSL 511.09□□□□□ -0.631e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 TMCO1-209ENST00000628579 477 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.661e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 PRDX6-202ENST00000460950 809 ntTSL 210.5□□□□□ -0.731e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 EIF3F-204ENST00000530219 2110 ntTSL 210.39□□□□□ -0.751e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 TMCO1-201ENST00000367881 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.791e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 MTIF2-204ENST00000403721 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.853e-9■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 ZFR-205ENST00000507465 1140 ntTSL 59.15□□□□□ -0.941e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 EIF3F-206ENST00000531572 485 ntTSL 29.1□□□□□ -0.951e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.951e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 VIM-202ENST00000421459 753 ntTSL 28.88□□□□□ -0.993e-9■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.11e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 EPRS-205ENST00000485821 598 ntTSL 37.86□□□□□ -1.151e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 MTIF2-203ENST00000394600 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.173e-9■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 MTIF2-209ENST00000418823 903 ntTSL 57.57□□□□□ -1.23e-9■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 PRDX6-203ENST00000470017 859 ntTSL 27.26□□□□□ -1.251e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.261e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 VIM-207ENST00000495528 962 ntTSL 27.05□□□□□ -1.283e-9■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.293e-9■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 ZCCHC9-206ENST00000505860 538 ntTSL 25.88□□□□□ -1.471e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.61e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.621e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 EIF3F-203ENST00000528763 609 ntTSL 24.55□□□□□ -1.681e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.71e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 YWHAZ-218ENST00000521607 750 ntTSL 34.07□□□□□ -1.761e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.771e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 VIM-210ENST00000637053 508 ntTSL 23.52□□□□□ -1.853e-9■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.514e-7■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.314e-45■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 DDX23-209ENST00000551189 587 ntTSL 49.1□□□□□ -0.951e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.351e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 AL365226.2-201ENST00000418403 397 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.013e-7■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 VEGFA-211ENST00000476772 1683 ntTSL 1 (best)26.74■■□□□ 1.876e-18■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 SEMA4C-205ENST00000474420 2625 ntTSL 218.14■□□□□ 0.498e-9■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 SEMA4C-204ENST00000467747 3371 ntTSL 213.92□□□□□ -0.188e-9■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 SEMA4C-206ENST00000482925 3776 ntTSL 212.75□□□□□ -0.378e-9■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.454e-8■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.333e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.23e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 SERPINH1-202ENST00000524558 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.513e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.745e-10■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.835e-10■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.055e-10■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.23e-8■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.352e-6■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 HSP90AA1-208ENST00000557234 584 ntTSL 320.24■□□□□ 0.835e-22■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 EIF4G1-238ENST00000493299 559 ntTSL 411.69□□□□□ -0.544e-7■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 EIF4G1-217ENST00000428387 524 ntTSL 410.33□□□□□ -0.764e-7■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 EIF4G1-236ENST00000484862 590 ntTSL 29.97□□□□□ -0.814e-7■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 HSP90AA1-206ENST00000556554 552 ntTSL 26.86□□□□□ -1.315e-22■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 HSP90AA1-203ENST00000553585 581 ntTSL 36.62□□□□□ -1.355e-22■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 NAP1L1-222ENST00000551992 1074 ntTSL 524.91■■□□□ 1.581e-69■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 NAP1L1-214ENST00000548273 818 ntTSL 314.04□□□□□ -0.161e-69■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 NAP1L1-221ENST00000551600 786 ntTSL 511.29□□□□□ -0.61e-69■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 NAP1L1-209ENST00000547704 760 ntTSL 511.29□□□□□ -0.61e-69■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 NAP1L1-218ENST00000550934 851 ntTSL 56.3□□□□□ -1.41e-69■■■□□ 15.1
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