Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAGPQ0VAQ4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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