Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTRLP40313 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTRLP40313 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTRLP40313 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTRLP40313 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTRLP40313 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTRLP40313 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTRLP40313 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTRLP40313 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTRLP40313 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTRLP40313 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTRLP40313 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTRLP40313 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTRLP40313 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTRLP40313 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTRLP40313 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTRLP40313 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTRLP40313 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTRLP40313 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTRLP40313 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTRLP40313 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTRLP40313 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTRLP40313 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTRLP40313 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTRLP40313 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTRLP40313 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTRLP40313 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTRLP40313 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTRLP40313 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTRLP40313 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTRLP40313 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTRLP40313 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTRLP40313 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTRLP40313 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTRLP40313 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTRLP40313 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTRLP40313 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTRLP40313 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTRLP40313 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTRLP40313 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTRLP40313 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTRLP40313 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTRLP40313 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTRLP40313 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTRLP40313 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTRLP40313 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTRLP40313 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTRLP40313 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTRLP40313 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTRLP40313 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTRLP40313 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTRLP40313 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CTRLP40313 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CTRLP40313 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTRLP40313 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTRLP40313 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTRLP40313 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTRLP40313 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTRLP40313 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTRLP40313 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTRLP40313 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTRLP40313 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTRLP40313 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CTRLP40313 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTRLP40313 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CTRLP40313 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTRLP40313 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTRLP40313 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTRLP40313 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTRLP40313 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTRLP40313 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTRLP40313 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTRLP40313 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTRLP40313 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTRLP40313 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTRLP40313 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTRLP40313 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTRLP40313 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTRLP40313 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTRLP40313 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTRLP40313 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTRLP40313 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CTRLP40313 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTRLP40313 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTRLP40313 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTRLP40313 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTRLP40313 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTRLP40313 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTRLP40313 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTRLP40313 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTRLP40313 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTRLP40313 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTRLP40313 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTRLP40313 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTRLP40313 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTRLP40313 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTRLP40313 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTRLP40313 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTRLP40313 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTRLP40313 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms