Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINB3P29508 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms