Protein–RNA interactions for Protein: P25089

FPR3, N-formyl peptide receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPR3P25089 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FPR3P25089 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FPR3P25089 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FPR3P25089 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FPR3P25089 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FPR3P25089 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FPR3P25089 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FPR3P25089 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FPR3P25089 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FPR3P25089 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FPR3P25089 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FPR3P25089 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FPR3P25089 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FPR3P25089 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FPR3P25089 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FPR3P25089 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FPR3P25089 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FPR3P25089 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FPR3P25089 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FPR3P25089 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FPR3P25089 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FPR3P25089 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FPR3P25089 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FPR3P25089 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FPR3P25089 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FPR3P25089 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FPR3P25089 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FPR3P25089 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FPR3P25089 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FPR3P25089 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FPR3P25089 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FPR3P25089 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FPR3P25089 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FPR3P25089 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FPR3P25089 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FPR3P25089 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FPR3P25089 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FPR3P25089 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FPR3P25089 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FPR3P25089 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FPR3P25089 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FPR3P25089 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FPR3P25089 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FPR3P25089 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FPR3P25089 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FPR3P25089 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FPR3P25089 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FPR3P25089 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FPR3P25089 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FPR3P25089 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FPR3P25089 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FPR3P25089 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FPR3P25089 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FPR3P25089 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FPR3P25089 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FPR3P25089 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FPR3P25089 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FPR3P25089 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FPR3P25089 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FPR3P25089 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FPR3P25089 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FPR3P25089 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FPR3P25089 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FPR3P25089 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FPR3P25089 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FPR3P25089 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FPR3P25089 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FPR3P25089 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FPR3P25089 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FPR3P25089 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FPR3P25089 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FPR3P25089 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FPR3P25089 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FPR3P25089 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FPR3P25089 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FPR3P25089 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FPR3P25089 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FPR3P25089 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FPR3P25089 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FPR3P25089 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FPR3P25089 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FPR3P25089 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FPR3P25089 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FPR3P25089 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FPR3P25089 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FPR3P25089 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FPR3P25089 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FPR3P25089 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FPR3P25089 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FPR3P25089 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FPR3P25089 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FPR3P25089 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FPR3P25089 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FPR3P25089 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FPR3P25089 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FPR3P25089 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FPR3P25089 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FPR3P25089 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FPR3P25089 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FPR3P25089 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms