Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
APAF1O14727 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
APAF1O14727 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
APAF1O14727 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
APAF1O14727 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
APAF1O14727 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
APAF1O14727 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
APAF1O14727 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
APAF1O14727 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
APAF1O14727 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
APAF1O14727 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
APAF1O14727 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
APAF1O14727 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
APAF1O14727 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
APAF1O14727 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
APAF1O14727 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
APAF1O14727 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
APAF1O14727 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
APAF1O14727 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
APAF1O14727 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
APAF1O14727 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
APAF1O14727 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
APAF1O14727 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
APAF1O14727 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
APAF1O14727 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
APAF1O14727 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
APAF1O14727 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
APAF1O14727 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
APAF1O14727 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
APAF1O14727 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
APAF1O14727 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
APAF1O14727 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
APAF1O14727 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
APAF1O14727 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
APAF1O14727 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
APAF1O14727 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
APAF1O14727 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
APAF1O14727 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
APAF1O14727 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
APAF1O14727 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
APAF1O14727 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
APAF1O14727 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
APAF1O14727 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APAF1O14727 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APAF1O14727 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APAF1O14727 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
APAF1O14727 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
APAF1O14727 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APAF1O14727 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
APAF1O14727 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APAF1O14727 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
APAF1O14727 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
APAF1O14727 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
APAF1O14727 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
APAF1O14727 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
APAF1O14727 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
APAF1O14727 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
APAF1O14727 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
APAF1O14727 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
APAF1O14727 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
APAF1O14727 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
APAF1O14727 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
APAF1O14727 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
APAF1O14727 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
APAF1O14727 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
APAF1O14727 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
APAF1O14727 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
APAF1O14727 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APAF1O14727 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APAF1O14727 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APAF1O14727 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APAF1O14727 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APAF1O14727 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APAF1O14727 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
APAF1O14727 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
APAF1O14727 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APAF1O14727 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
APAF1O14727 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
APAF1O14727 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
APAF1O14727 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
APAF1O14727 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
APAF1O14727 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
APAF1O14727 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
APAF1O14727 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
APAF1O14727 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
APAF1O14727 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
APAF1O14727 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
APAF1O14727 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
APAF1O14727 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
APAF1O14727 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
APAF1O14727 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
APAF1O14727 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
APAF1O14727 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
APAF1O14727 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
APAF1O14727 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
APAF1O14727 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
APAF1O14727 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
APAF1O14727 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
APAF1O14727 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
APAF1O14727 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms