Protein–RNA interactions for Protein: A8MUA0

Putative UPF0607 protein ENSP00000381514, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MUA0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A8MUA0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A8MUA0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A8MUA0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A8MUA0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A8MUA0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MUA0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MUA0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MUA0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MUA0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MUA0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MUA0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MUA0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MUA0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MUA0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MUA0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MUA0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MUA0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A8MUA0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MUA0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MUA0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MUA0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MUA0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MUA0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MUA0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MUA0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MUA0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MUA0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MUA0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MUA0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MUA0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MUA0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MUA0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
A8MUA0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A8MUA0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
A8MUA0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
A8MUA0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A8MUA0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
A8MUA0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A8MUA0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
A8MUA0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
A8MUA0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
A8MUA0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
A8MUA0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
A8MUA0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
A8MUA0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
A8MUA0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
A8MUA0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
A8MUA0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
A8MUA0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
A8MUA0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
A8MUA0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
A8MUA0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
A8MUA0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
A8MUA0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
A8MUA0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A8MUA0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A8MUA0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A8MUA0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A8MUA0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
A8MUA0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
A8MUA0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21■□□□□ 0.95
A8MUA0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
A8MUA0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
A8MUA0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
A8MUA0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A8MUA0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A8MUA0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
A8MUA0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A8MUA0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MUA0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MUA0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MUA0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MUA0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MUA0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MUA0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MUA0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MUA0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MUA0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A8MUA0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A8MUA0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A8MUA0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
A8MUA0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A8MUA0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
A8MUA0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A8MUA0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A8MUA0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A8MUA0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
A8MUA0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
A8MUA0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
A8MUA0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
A8MUA0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
A8MUA0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
A8MUA0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
A8MUA0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
A8MUA0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
A8MUA0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
A8MUA0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
A8MUA0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
A8MUA0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms