Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HELTA6NFD8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms